2024年上半年度，Ausbian®品牌系列血清，助力腫瘤相關(guān)研究，幫助多項(xiàng)科研成果成功并發(fā)表。本期內(nèi)容，與締一生物小助手一起，看看各位科學(xué)界的同仁都發(fā)表了哪些科技論文。

《Research Square》

Deciphering the effects of PYCR family on cell function, prognostic value, immune in ltration in ccRCC and pan-cancer

研究內(nèi)容：

吡咯-5-羧酸還原酶(PYCR)是將吡咯-5-羧酸(P5C)轉(zhuǎn)化為脯氨酸的關(guān)鍵，脯氨酸是脯氨酸合成的最后一步。PYCR1、PYCR2和PYCR3三種異構(gòu)體存在，并在腫瘤的發(fā)生和發(fā)展中發(fā)揮著重要的調(diào)節(jié)作用。在這項(xiàng)研究中，科研人員先通過泛癌癥分析評(píng)估PYCRs的分子和免疫特征，特別是關(guān)注它們與預(yù)后的相關(guān)性。然后，建立腎透明細(xì)胞癌(KIRC)特異性預(yù)后模型，結(jié)合病理特征來增強(qiáng)預(yù)測能力。通過體外實(shí)驗(yàn)研究PYCR1和PYCR2在腎癌細(xì)胞中的生物學(xué)功能和調(diào)控機(jī)制。PYCRs在多種腫瘤中的表達(dá)均升高，與不良臨床結(jié)果相關(guān)。PYCRs在腫瘤信號(hào)通路中富集，與免疫細(xì)胞濾過、腫瘤突變負(fù)荷(TMB)和微衛(wèi)星不穩(wěn)定性(MSI)顯著相關(guān)。在KIRC中，基于PYCR1和PYCR2的預(yù)后模型在統(tǒng)計(jì)學(xué)上得到了獨(dú)立驗(yàn)證。利用h&e染色圖像的特征，病理特征模型可靠地預(yù)測患者預(yù)后。體外實(shí)驗(yàn)表明，PYCR1和PYCR2通過激活mTOR通路，至少部分地增強(qiáng)了腎癌細(xì)胞的增殖和遷移。

其中，對(duì)人腎細(xì)胞癌細(xì)胞系，即Caki-1、786- 0和A498的體外培養(yǎng)，用到了Ausbian胎牛血清。

《PLOS ONE》

Functional analysis of ESM1 by shRNA-mediated knockdown of its expression in papillary thyroid cancer cells

研究內(nèi)容：

內(nèi)皮特異性分子-1 (ESM1)是多種人類癌癥的致癌基因。然而，ESM1在乳頭狀甲狀腺癌(PTC)中的功能尚不清楚。該研究旨在探討ESM1對(duì)PTC生長、遷移和侵襲的影響，為PTC的治療提供新的視角。采用免疫組化方法檢測53例腫瘤組織樣本和59例匹配的鄰近正常組織樣本PTC組織中ESM1的表達(dá)水平。通過在TPC-1和SW579細(xì)胞系中敲低ESM1的表達(dá)來研究其在PTC中的作用。此外，通過體外細(xì)胞增殖、凋亡、傷口愈合和transwell實(shí)驗(yàn)來評(píng)估細(xì)胞增殖、遷移和侵襲。結(jié)果顯示，ESM1在PTC組織中的表達(dá)明顯高于在副腫瘤組織中的表達(dá)(P<0.0001)。在體外實(shí)驗(yàn)中，敲低ESM1表達(dá)可抑制TPC-1和SW579細(xì)胞的增殖、遷移和侵襲。與對(duì)照組相比，PTC細(xì)胞中ESM1表達(dá)下調(diào)后，其mRNA和蛋白水平均顯著降低(P<0.01)。此外，敲低esm1的細(xì)胞增殖能力降低，遷移和侵襲能力降低(P<0.01, P<0.01, P<0.001)。

得出結(jié)論ESM1是PTC發(fā)生發(fā)展的重要基因，可以促進(jìn)PTC細(xì)胞的增殖、遷移和侵襲。它可能是一個(gè)很有前途的診斷和治療靶基因。

其中，對(duì)人甲狀腺癌細(xì)胞系：TPC-1、SW579和BCPAP的體外培養(yǎng)，用到了Ausbian胎牛血清。

《scientific reports》

Hesperetin promotes bladder cancer cells death via the PI3K/AKT pathway by network pharmacology and molecular docking

研究內(nèi)容：

膀胱癌(BLCA)患者在手術(shù)和化療后仍有高復(fù)發(fā)率。橙皮苷(Hesperetin, HE)作為一種天然化合物，因其毒性低、易于獲取而備受關(guān)注。然而，HE對(duì)BLCA的抑制作用尚不清楚。利用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法預(yù)測HE調(diào)控的中樞基因和富集途徑在BLCA治療中的作用。可視化了HE蛋白與樞紐蛋白的分子對(duì)接。用菌落和CCK8檢測細(xì)胞增殖，用transwell和傷口愈合檢測證實(shí)BLCA遷移。此外，通過Hoechst染色、透射電鏡(TEM)和活性氧(ROS)測定證實(shí)了細(xì)胞凋亡和鐵下垂的發(fā)生。Western Blotting驗(yàn)證中心蛋白、靶功能和通路。SRC, PIK3R1和MAPK1被確定為BLCA中HE的樞紐靶點(diǎn)，涉及PI3k/AKT通路。此外，HE抑制BLCA細(xì)胞的增殖和遷移。HE顯著抑制MMP2/MMP9蛋白表達(dá)。Bax和cleaved caspase-3的表達(dá)增加表明HE可促進(jìn)BLCA細(xì)胞凋亡。此外，Hoechst染色顯示凋亡核的集中和照亮。ROS的激活和GPX4表達(dá)的下降提示HE可能通過抗blca過程誘導(dǎo)鐵下垂。HE處理的BLCA細(xì)胞線粒體縮小，凋亡小體出現(xiàn)，線粒體嵴減少或缺失。科研人員提出HE可以抑制BLCA細(xì)胞的增殖和遷移，促進(jìn)細(xì)胞凋亡和鐵下垂。HE可能通過靶向SRC、PIK3R1和MAPK1等蛋白以及PI3K/AKT通路發(fā)揮作用。

其中，對(duì)人膀胱癌細(xì)胞T24(HTB-4)和5637(HTB-9)的體外培養(yǎng)，用到了Ausbian胎牛血清。

《cell death & disease》

Modification of BCLX pre-mRNA splicing has antitumor efficacy alone or in combination with radiotherapy in human glioblastoma cells

實(shí)驗(yàn)內(nèi)容：

由異常剪接引起的抗凋亡和促凋亡蛋白異構(gòu)體的失調(diào)是癌癥的一個(gè)重要標(biāo)志，并可能導(dǎo)致治療耐藥性。因此，靶向RNA剪接來重定向凋亡相關(guān)基因的異構(gòu)體表達(dá)可能會(huì)導(dǎo)致有希望的抗癌表型。膠質(zhì)母細(xì)胞瘤(GBM)是成人常見的惡性腦腫瘤。在該研究中，通過RT-PCR和Western Blot分析發(fā)現(xiàn)，BCLX pre-mRNA在GBM細(xì)胞中存在異常剪接，其中抗凋亡的Bcl-xL剪接更有利。使用剪接開關(guān)寡核苷酸(SSOs)調(diào)節(jié)BCLX pre-mRNA剪接可以有效地提高促凋亡異構(gòu)體Bcl-xS，而降低抗凋亡的Bcl-xL。SSOs誘導(dǎo)Bcl-xS可激活GBM細(xì)胞凋亡和自噬。此外，科研人員發(fā)現(xiàn)電離輻射也可以調(diào)節(jié)BCLX的選擇性剪接。與重(碳)離子輻照相比，低能x射線輻照誘導(dǎo)Bcl-xL/Bcl-xS的比值增加。通過剪接調(diào)控抑制Bcl-xL可顯著增強(qiáng)二維和三維GBM細(xì)胞的輻射敏感性。這些結(jié)果表明，通過剪接開關(guān)寡核苷酸操縱BCLX前mrna選擇性剪接是一種單獨(dú)或聯(lián)合放療抑制膠質(zhì)母細(xì)胞瘤腫瘤發(fā)生的新方法。

其中，對(duì)膠質(zhì)母細(xì)胞瘤：A172, T98G, U251, U87, GSCs(人膠質(zhì)瘤干細(xì)胞樣細(xì)胞)，以及正常的人星形膠質(zhì)細(xì)胞系HA1800的體外培養(yǎng)實(shí)驗(yàn)，均用到了Ausbian胎牛血清。

《APS》

O-GlcNAcylation mediates H2O2-induced apoptosis through

 regulation of STAT3 and FOXO1

研究內(nèi)容：O-linked-β- n -乙酰氨基葡萄糖(O-GlcNAc)糖基化(o - glcnac酰化)是一種關(guān)鍵的翻譯后修飾，將外部刺激與細(xì)胞內(nèi)信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)網(wǎng)絡(luò)偶聯(lián)。然而，o - glcn酰化在氧化應(yīng)激誘導(dǎo)的細(xì)胞凋亡中的關(guān)鍵蛋白靶點(diǎn)仍有待闡明。在這里，我們發(fā)現(xiàn)H2O2處理抑制o - glcn酰化，損害細(xì)胞活力，增加裂解caspase 3，加速神經(jīng)母細(xì)胞瘤N2a細(xì)胞的凋亡。O-GlcNAc轉(zhuǎn)移酶(OGT)抑制劑OSMI-1或O-GlcNAcase (OGA)抑制劑Thiamet-G分別增強(qiáng)或抑制h2o2誘導(dǎo)的細(xì)胞凋亡。OSMI-1抑制了總蛋白和磷酸化蛋白水平以及轉(zhuǎn)錄因子3 (STAT3)和叉頭盒蛋白O1 (FOXO1)的啟動(dòng)子活性。相反，過表達(dá)OGT或用Thiamet-G處理會(huì)增加STAT3和fox01的總蛋白水平。STAT3或FOXO1過表達(dá)可消除osmi -1誘導(dǎo)的細(xì)胞凋亡。而在H2O2處理的細(xì)胞中，OGT和Thiamet-G的抗凋亡作用通過下調(diào)內(nèi)源性STAT3或fox01的表達(dá)或活性而被消除。這些結(jié)果表明STAT3或fox01是參與H2O2誘導(dǎo)的N2a細(xì)胞凋亡的o - glcnac酰化的潛在靶點(diǎn)。

其中，對(duì)神經(jīng)元-2a神經(jīng)母細(xì)胞瘤細(xì)胞（N2a Cell）的體外培養(yǎng)，用到了Ausbian胎牛血清。

《Biology Direct》

RPL35A promotes the progression of cholangiocarcinoma by mediating HSPA8 ubiquitination

研究內(nèi)容：

膽管癌(CCA)是一種膽道上皮惡性腫瘤，在世界范圍內(nèi)發(fā)病率不斷上升。因此，需要進(jìn)一步了解CCA進(jìn)展的分子機(jī)制，以確定新的治療靶點(diǎn)。免疫組化染色檢測RPL35A在CCA和癌旁組織中的表達(dá)。IP-MS聯(lián)合Co-IP鑒定了RPL35A調(diào)控的下游蛋白。采用Western blot和Co-IP對(duì)CHX或MG-132處理的CCA細(xì)胞進(jìn)行檢測，驗(yàn)證RPL35A對(duì)HSPA8蛋白的調(diào)控作用。通過細(xì)胞實(shí)驗(yàn)和裸鼠皮下腫瘤發(fā)生實(shí)驗(yàn)，在體內(nèi)評(píng)價(jià)RPL35A和HSPA8對(duì)CCA細(xì)胞增殖、凋亡、細(xì)胞周期、遷移和腫瘤生長的影響。RPL35A在CCA組織和細(xì)胞中顯著上調(diào)。RPL35A敲低抑制hcc -9810和HUCCT1細(xì)胞的增殖和遷移，誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡，使細(xì)胞周期停留在G1期。HSPA8是RPL35A的下游蛋白，在CCA中過表達(dá)。RPL35A敲低會(huì)損害HSPA8蛋白的穩(wěn)定性，增加HSPA8蛋白的泛素化水平。RPL35A過表達(dá)促進(jìn)CCA細(xì)胞增殖和遷移。HSPA8敲低抑制CCA細(xì)胞增殖和遷移，逆轉(zhuǎn)RPL35A的促進(jìn)作用。此外，RPL35A在體內(nèi)促進(jìn)腫瘤生長。相反，HSPA8敲低抑制腫瘤生長，同時(shí)能夠恢復(fù)RPL35A過表達(dá)的效果。RPL35A在CCA組織中表達(dá)上調(diào)，通過介導(dǎo)HSPA8泛素化促進(jìn)CCA的進(jìn)展。

其中，對(duì)4種膽管癌細(xì)胞系(hcc -9810、HUCCT1、QBC939、RBE細(xì)胞)和人肝內(nèi)膽管上皮細(xì)胞(HIBEC細(xì)胞)的體外培養(yǎng)，均用到了Ausbian胎牛血清。

《PLOS PATHOGENS》

Serine protease Rv2569c facilitates transmission of Mycobacterium tuberculosis via disrupting the epithelial barrier by cleaving E-cadherin

研究內(nèi)容：

上皮細(xì)胞是抵御病原體入侵的主要防線。然而，細(xì)菌病原體具有破壞這一屏障并促進(jìn)細(xì)菌遷移的能力。然而，結(jié)核分枝桿菌(M.tb)在這一過程中所采用的具體分子機(jī)制尚不清楚。科研人員通過評(píng)估Rv2569c切割e -鈣粘蛋白的能力來研究Rv2569c在結(jié)核分枝桿菌易位中的作用，e -鈣粘蛋白是細(xì)胞-細(xì)胞粘附連接的重要組成部分，在細(xì)菌入侵期間被破壞。利用在大腸桿菌中表達(dá)并通過親和層析純化的重組Rv2569c，科研人員證明了Rv2569c具有細(xì)胞壁相關(guān)絲氨酸蛋白酶活性。此外，Rv2569c能夠降解一系列蛋白質(zhì)底物，包括酪蛋白、纖維蛋白原、纖維連接蛋白和e -鈣粘蛋白。科研人員還確定了Rv2569c蛋白酶活性的適宜條件是溫度為37℃，pH為9.0,MgCl2存在。為了研究Rv2569c在結(jié)核分枝桿菌中的功能，科研人員制備了Rv2569c的缺失突變體及其補(bǔ)充菌株，并將其用于感染A549細(xì)胞和小鼠。A549細(xì)胞感染實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示，Rv2569c具有裂解E-cadherin的能力，促進(jìn)M.tb通過極化的A549上皮細(xì)胞層遷移。此外，體內(nèi)感染實(shí)驗(yàn)表明，Rv2569c可以破壞E-cadherin，增強(qiáng)M.tb的定植，并在C57BL/6小鼠的肺部引起病理損傷。總之，這些結(jié)果強(qiáng)烈表明結(jié)核分枝桿菌利用絲氨酸蛋白酶Rv2569c破壞上皮防御，并通過跨越上皮屏障促進(jìn)其全身傳播。

其中，對(duì)肺腺癌細(xì)胞系A549的體外培養(yǎng)，用到了Ausbian胎牛血清。